Ген ApoE кодирует аминокислотную последовательность белка aполипопротеина Е. Aполипопротеин Е синтезируется в печени и в головном мозге. Он играет существенную роль в метаболизме липидов. Различные аллельные варианты гена обуславливают разные биологические свойства aполипопротеина Е. Наиболее часто встречаются аллельные варианты гена ApoE — *2 (E2), *3 (E3), *4 (E4). Аллель Е4 связана с высоким уровнем холестерина в плазме крови. Носители этого аллельного варианта должны пожизненно соблюдать низкохолестериновую диету.
Ген PON1 кодирует аминокислотную последовательность фермента параоксоназа 1. В организме параоксоназа 1 тесно связана с комплексом липопротеидов высокой плотности ЛПВП, а так же обладает антиоксидантными и антиатерогенными свойствами, препятствуя окислению липидов в ЛПНП путем их гидролиза. Аллельные варианты 107C>T, L54M и Q192R связаны с низким уровнем параоксоназы в плазме крови. Носители этого аллельного варианта имеют низкую антиатерогенную защиту и должны учитывать это при выборе рациона.